Puis a lieu la première expansion urbaine de la population, qui se rompt longitudinalement vers le sud-ouest avec son ancienne structure fortifiée. Le long de cet axe s'élèvent le Pósito, siège de la mairie, et l'église de Ntra. Sra. De la Concepción, une paroisse debout jusqu'en 1955, l'année où l'actuelle a été construite sur elle, perdant la population l'une des deux paroisses historiques qu'elle avait dans le passé. L'autre paroisse se dresse en ruine dans l'enceinte inférieure de la forteresse, configurant avec elle et la nature splendide de la Sierra qui l'encadre l'un des plus beaux endroits de la province de Jaén. Ce deuxième temple, dédié à Saint-Domingue, est le résultat des efforts de l'un des hommes les plus influents de l'Espagne de Carlos I, le célèbre et arrogant secrétaire Francisco de los Cobos, qui a réussi à prendre la direction de l'avancement en 1534, restant sous l'administration et le contrôle de ses descendants, les marquis de Camarasa, jusqu'en 1606, date à laquelle il fut récupéré par l'archevêché de Tolède, propriétaire du vaste domaine depuis le XIIIe siècle. Pendant cette période, ce que Rus Puerta qualifie d'Iglesia Mayor serait construit. Mais ce temple monumental présente un certain abandon et une ruine au XVIIIe siècle.

Dans le Cadastre du Marqués de la Ensenada, de 1751, l'état dans lequel il a été trouvé est ainsi relaté: «(...) ce qui cause la plus grande douleur, c'est de voir l'usine de la grande paroisse de Santo Domingo de SIlos être fini, étant assez décent, et à cause des nombreux harcèlements et toitures avec lesquels il se trouve aujourd'hui, parce qu'il n'est pas parfait il subit le détriment continu de telles dépenses continues pour pouvoir se préserver (: ..) ». La guerre d'indépendance a causé sa ruine totale, car elle a été incendiée, comme Santa María, de Cazorla, le 4 juillet 1810 par les troupes françaises. Plus tard, il fut utilisé comme cimetière jusqu'au milieu du XXe siècle, les vestiges de cette occupation étant encore visibles.

Selon Vicente Salvatierra, il semble très possible que l'église d'origine ait pu se trouver au même endroit que celle de Saint-Domingue, au pied du château. De l'avis de Luis Magaña, Rodrigo de Gibaja, maître tailleur de pierre lié à l'archidiocèse de Tolède et responsable des usines de la Colegial de Baeza et de l'église de Puebla de Don Fabrique, à Grenade, était en charge des travaux de la églises de Santa María, de Quesada et de Santo Domingo de La Iruela. La participation du tailleur de pierre de Cazorlan Gabriel de Tauste a également été documentée. Il n'y a aucune preuve documentaire de l'intervention d'Andrés de Vandelvira, mais il est très probable qu'il ait donné les plans à la demande de Francisco de los Cobos vers 1534, prenant en charge l'exécution Gibaja et Tauste, entre autres maîtres tailleurs de pierre.

Chueca Goitia, comparant les vestiges des églises de Santa María, de Cazorla, à celle de La Iruela, estime que cette dernière "est d'un art plus pauvre et plus grossier, tel qu'il est fait par des maîtres locaux suivant, sûrement, des inspirations vandelviresques". Dans tous les cas, les deux usines sont construites en parallèle, celle de Cazorla s'agrandissant avec le temps. De ce temple monumental, seule une partie des murs d'enceinte, les portails d'accès, l'escalier en colimaçon pour accéder au clocher, les chapelles principale et collatérale et un portail monumental sur le côté de l'Évangile avec un relief dans lequel est Il représente le miracle de l'imposition de la chasuble à San Ildefonso. La plante avait trois nefs et la tête était plate et proéminente.

Certains éléments décoratifs, la disposition des portes d'accès et, surtout, la composition de l'élévation des murs du transept ou de la première grande section, articulés par un grand arc en plein cintre dans la partie supérieure et deux chapelles dans la partie inférieure séparées entre si par un pilastre avec une niche veinée, ils sont clairement vandelviens. Dans la cathédrale de Jaén ou à San Isidoro de Úbeda, Andrés de Vandelvira a incorporé monumentalement cette composition, exécutée avec plus de simplicité dans le cas de La Iruela.