Sa construction a commencé en 1538, avec un taux de croissance très lent en raison de la rareté des ressources économiques. Il a été construit presque dans son intégralité à la fin du même XVIe siècle, en travaillant sur lui le célèbre architecte jaen Ginés Martínez de Aranda.

Au cours du XVIIe siècle, les travaux reprirent et dans le premier tiers du XVIIIe siècle la sacristie, le cloître et la chapelle principale furent achevés; et à la fin du 18ème siècle, la tour a été construite, ce qui contraste stylistiquement avec le reste de l'église.