Das Museumsgebäude ist besonders bemerkenswert, da es sich um ein Mudéjar-Haus handelt, ein wunderschönes Gebäude aus dem 14. Jahrhundert, das während der Bauarbeiten entdeckt wurde. Es ist als Casa Mudéjar bekannt und präsentiert ein Repertoire von Stücken aus der Altsteinzeit in der Provinz sowie Gegenstände aus der Bronzezeit, die im Stadtteil Alcázar im Stadtzentrum von Úbeda ausgegraben wurden. Die Stücke aus der Römerzeit stammen aus Úbeda, la Vieja (der von Augusto gegründeten Colonia Salaria). Wir finden auch Stücke aus der iberischen Stätte von Castellones de Ceal und iberische Votivgaben aus dem Heiligtum des Collado de los Jardines.