Le musée archéologique se compose de trois salles, une première salle dédiée à la préhistoire, où vous pouvez voir tous les vestiges matériels de l'âge paléolithique, mésolithique, néolithique, chalcolithique et métallique.

Le contenu des vitrines de cette salle est très riche. Dans une première, découverte de vestiges lithiques du Paléolithique moyen tels que les Proto-Bifaces aux flèches argariques de type "Palmeta", déjà réalisées à l'ère du métal. a reconstitution d'une grotte paléolithique et d'une cabane néolithique, qui devient le pari didactique de cette salle.

La deuxième salle est consacrée à l'histoire, des peuples colonisateurs aux temps modernes, mettant en évidence un échantillon important de vestiges épigraphiques ibériques, romains et musulmans, ainsi qu'une collection numismatique vaste et très complète. À cela s'ajoutent toutes sortes d'artefacts en céramique, en verre et en marbre qui font de cette salle la plus complète du musée.Dans cette salle, il est également engagé dans l'interprétation des monuments archéologiques, en l'occurrence la reconstruction à l'échelle réelle du tombeau princier. de la nécropole de Piquía, une tombe de dimensions importantes dans laquelle un équipement funéraire de premier plan a été trouvé, parmi lesquels se détachent un total de 7 récipients en céramique attique, dont 4 ont été restaurés par l'équipe d'archéologie ibérique du Centre andalou de l'Université de Jaén.

La troisième salle est dédiée à deux personnages illustres de l'Histoire d'Arjona, El Rey Alhamar et Helvia Paulina, tous deux nés à Arjona, qui ont été très importants respectivement dans leurs périodes musulmane et romaine respective. Cette salle est complétée par une salle audiovisuelle, qui a été créée dans le but de compléter les activités programmées par le musée pour le visiteur.