Au Moyen Âge, Santo Tomé était lié à l'archevêché de Tolède et faisait partie du territoire de l'avancement de Cazorla. Pour répondre aux objectifs défensifs, un château a été construit au 14ème siècle dont il ne reste que le donjon, avec une base rectangulaire, presque carrée et avec un seul étage, qui a réussi à être préservé en étant incorporé en clocher sur le côté gauche de l'église . La tour, qui conserve ses caractéristiques gothiques, est faite de maçonnerie et de cours réguliers au rez-de-chaussée et de pierre de taille sur la partie supérieure, et est couverte par un toit. Lorsque la fonction militaire d'origine a été changée en fonction religieuse, un beffroi en pierre a été ajouté avec deux trous pour les cloches, la corniche et le fronton triangulaire qui abrite une autre cloche. Il a été déclaré bien d'intérêt culturel en 1985.