Son aspect extérieur n'est pas très élégant mais attrayant en raison de ses contrastes volumétriques. Réalisée en maçonnerie, la porte encadrée par une corniche moulurée s'ouvre par un arc en plein cintre sur des impostes à dos plat et écoinçons. Sur son axe, il y a un haut beffroi avec deux sections, celle du bas avec deux arcs semi-circulaires et celle du haut avec un, un fronton triangulaire et de petits vases. Il conserve un autre portail en pierre sculptée ayant appartenu au palais du Marqués de la Cueva.

Son plan d'étage est rectangulaire et se compose d'une seule nef couverte d'une fausse voûte en berceau de gypse, avec de fausses arcs transversaux soutenus par des pilastres d'architrave. La nef et le presbytère - auxquels on accède par un arc principal abaissé et recouvert d'une voûte demi-orange sur pendentifs - sont décorés de motifs géométriques et de thèmes végétaux. Le chœur est situé au pied et est soutenu par deux colonnes à semelles. Le dressing a un plan d'étage polygonal, il a été construit au début du 18ème siècle et a subi diverses réformes et modifications.

Il est possible que la dévotion à la Virgen de Cuadros remonte au Moyen Âge car elle correspond à une région très active militairement dans la conquête chrétienne et avec une activité essentiellement agricole. La relance de son culte était basée sur le modèle de religiosité populaire promu par le Concile de Trente et sur la politique ecclésiastique menée dans la province par Mgr Dávila. L'importance de la procession et de la revendication du pèlerinage des pèlerins du sanctuaire de la Virgen de Cuadros dépasse sa valeur artistique et monumentale.